Die Monumenta Germaniae Historica schließen mit der Historischen Kommission bei der Bayerischen Akademie der Wissenschaften eine Kooperationsvereinbarung, um ihre Aktivitäten zu vernetzen und Synergien in der Nutzung digitaler, organisatorischer und wissenschaftlicher Ressourcen zu schaffen. Beide Einrichtungen sind in der historischen Grundlagenforschung tätig und Mitglieder im Kompetenzverbund Historische Wissenschaften München.
Quelleneditionen als Brücke zwischen Archiv und Forschung sind für die historischen Wissenschaften unverzichtbar. An den Universitäten kann die dafür erforderliche langfristige Forschung kaum geleistet werden. MGH und HiKo hingegen verfügen über ein in fast bzw. mehr als 200 Jahren gesammeltes Know-How und führen ihre Kompetenzen in der Herausgabe kritischer Quelleneditionen vor allem im Bereich digitaler Editionen zusammen, um dort weiterhin wissenschaftliche Standards zu setzen. Da das Editionshandwerk besondere Fertigkeiten verlangt, ist für beide Einrichtungen daneben die Nachwuchsförderung ein zentrales Anliegen.
Auch mit den Ergebnissen ihrer biografisch-lexikografischen Arbeit, mit quellenbasiertem „zertifizierten Wissen“ stellen MGH und HiKo Informationen zur Verfügung, mit denen sie eine über die Fachwissenschaft hinausreichende Öffentlichkeit erreichen, was hohe Zugriffszahlen belegen. Ihr dauerhaft kuratiertes und wissenschaftlichen Anforderungen genügendes Angebot bietet eine verlässliche Position gegen Fake News und Geschichtsfälschungen.